Лимнологический институт был организован на базе
Байкальской лимнологической станции (1 октября 1928 г.). Это было первое научное учреждение
Академии наук в Сибири. Постановлением Президиума АН СССР N49 от 20.01.1961 станция
реорганизована в Лимнологический институт СО АН СССР
Первым директором сначала станции, а затем Института был ак. Григорий Иванович Галазий
Институт является научным учреждением, выполняющим междисциплинарные
комплексные исследования озера Байкал и других водоемов Сибири. Основное
научное направление деятельности Института - "Лимнология: механизмы
образования, биоразнообразие, эволюция, современное состояние и прогноз
развития водоемов и водотоков суши".
В рамках научного направления Институт ведет научные исследования по
выяснению закономерностей функционирования экосистемы озера Байкал.
Изучаются: осадки озера Байкал как непрерывная высокоразрешающая летопись
палеоклиматов Восточной Сибири, механизмы вертикального водообмена и влияние
гидрофизических факторов на биологические процессы, в том числе на экологию
эндемичных видов; биоразнообразие эндемичной фауны и флоры; филогенетические
связи внутри различных групп байкальских организмов и их взаимоотношения с
внебайкальскими формами; молекулярная филогения байкальских и внебайкальских
организмов; химический состав байкальских вод, донных осадков, биологических
объектов; пути миграции экотоксикантов по трофическим цепям; состав аэрозолей
в атмосфере над Байкалом. Особое внимание уделяется разработке и внедрению
новых методов, точности используемых методов и приборов.